Добрый день, Александр.
В нашем распоряжении нет сводной и систематизированной информации по вашему вопросу. А подготовка такого списка это большая исследовательская работа, которая не входит в нашу компетенцию.
Предлагаем то, что удалось найти в доступных нам источниках.
Прежде всего, необходимо определиться с понятием "воинские храмы". Мы включили сюда в том числе храмы, построенные в казачьих острогах в период создания на Алтае Бийской казачьей линии (за исключением Семипалатинского уезда, входившего в свое время в Алтайскую губернию, позднее отошедшего в состав Казахстана).
Предлагаем вам выдержки из Списка "Храмы Сибирского казачьего войска", касающиеся Бийского и Змеиногорского уездов:
Храмы Сибирской казачьей линии.jpg.
(Источник: Тобольск и вся Сибирь. 14. Сибирское казачье войско: альманах / ред. совет Ю. С. Осипов [и др.] .- Тобольск: Обществ. благотвор. фонд "Возрождение Тобольска", 2011.-С.289-309).
В с. Антоньевка Быстро-Истокского района храм был закрыт в 1931 г под культурно-просветительские цели (Постановление 2318 от 3 марта 1931 г.), в с. Тулаты Чарышского района в 1935 г . (постановление 1914 от 26 октября 1935 г.).
Кроме того, было еще несколько острожных храмов:
- в Берском остроге церковь Сретения Господня деревянная, к которой приходских дворов 217 (на 1751 г.);
- в Белоярском остроге Петропавловская церковь (на 1751 г.);
- в ст.Чарышской была походная церковь Св. Мучеников Кирика и Иулиты (1876 г. постройки).
(Источник: Документы по истории церквей и вероисповеданий в Алтайском крае (XVII начало XXв.-Барнаул, 1997)
В Бикатунской крепости (ныне г. Бийск) Петропавловская церковь - первый православный храм в крепости, к настоящему времени не сохранился.Судя по планам Бийска 1748 и 1750 гг., церковь располагалась в том месте, где сейчас находится поселок лесозавода. Приказ о ее строительстве был получен на Рождество 1748 г. Сооружали храм силами местных казаков и военного гарнизона драгун и солдат-пехотинцев. Сооружение Петропавловской церкви закончилось осенью 1749 года, но ее освещение задержалось из-за несвоевременной присылки церковной утвари до весны следующего года. Оно состоялось 23 апреля 1750 года, в канун празднования Святой Пасхи. Кроме гарнизона крепости и ее гражданского населения сюда входили жители 14 окрестных деревень.
Во время летнего пожара 1778 г. храм сильно пострадал. Службы в нем были прекращены и, вероятно, в первой трети XIX века он был разобран.
Успенская церковь (Бийск) - перестраивалась неоднократно.
Первая деревянная церковь была сооружена в Бикатунской крепости летом 1774 года. Строили её под руководством коменданта крепости Петра Четова. Священнослужители проводили службы здесь с 1774 года по 1830. Решение снести обветшалую церковь было принято при перепланировке города и возведении новых кварталов. Строительством второй Успенской церкви занимался другой комендант полковник Богданов. Закончилось возведение в 1789 году, а освящена она была спустя пять лет в 1794. Помимо основного названия, у Успенской церкви Бийска было и второе народное. Горожане именовали её казачьей, ведь прихожанами были казаки и их семьи. В связи с тем, что численность населения стремительно увеличивалась, церковь уже не вмещала всех прихожан. К тому же она изрядно обветшала. А потому в 1901 году власти города признали церковь аварийной, а затем и упразднили ее.
В Барнауле в феврале 1906 г. была построена войсковая (гарнизонная, полковая) церковь в имя Святителя Николая Мирликийского Чудотворца. В 1930-х годах церковь была закрыта. В начале 1990-х гг. проведена реставрация храма, в 1993 он был освящен. (Адрес: Алтайский край, г. Барнаул, пр. Ленина, 36).
В гастоящее время в ЗАТО "Сибирский" работает храм Святой великомученицы Варвары, построен в декабре 2001 года.
Всего доброго!